儿童慢性咳嗽的常见病因与成人有所不同，其治疗手段也有所不同。
尽管儿童和成人的呼吸系统在生理学上有相似之处，但青春期前儿童和成人之间也存在着方方面面的差异，比如解剖结构（气道、呼吸肌和胸壁）、睡眠相关特征的成熟度差异、性别差异、呼吸反射和呼吸控制等。与成年人相比，儿童咳嗽的敏感性主要受到气道口径（FEV1）和年龄的影响。
急性咳嗽通常是由呼吸道病毒感染引起，而慢性咳嗽则根据孩子年龄不同，病因有所差异：6岁儿童的慢性咳嗽最可能是由感染后咳嗽、咳嗽变异性哮喘和上气道咳嗽综合征引起，其中婴幼儿需警惕异物吸入，有误食、呛咳经历的家长应格外重视；≥6岁儿童则以咳嗽变异性哮喘和上气道咳嗽综合征为主，随着年龄增长，学龄期、青春期孩子更易出现心因性咳嗽或多病因性咳嗽（如咳嗽变异性哮喘合并上气道咳嗽综合征）。
解释说明：（1）咳嗽变异性哮喘，以慢性咳嗽为主要或唯一临床表现的一种特殊类型哮喘，咳嗽多发生在夜间、凌晨或运动后，常为刺激性干咳；（2）上气道咳嗽综合征，各种鼻炎、鼻窦炎、慢性咽炎、腭扁桃体和（或）增殖体肥大、鼻息肉等上气道疾病均可能引起慢性咳嗽；（3）感染后咳嗽，继发于病毒、细菌、支原体等病原体引起的呼吸道感染后发生的一组疾病，主要见于急性上呼吸道感染后，由于急性上呼吸道感染中普通感冒最常见，因此以前称之为“感冒后咳嗽”。
大多数时候，抗菌药物就是平时我们所说的“抗生素、消炎药”。急性咳嗽大多是呼吸道病毒感染所致，抗菌药物并没有治疗作用，且上呼吸道感染为自限性疾病，不用药也可自行好转。滥用药不仅不能缓解咳嗽，反而可能造成肝肾功能损害、诱导细菌耐药、掩盖症状导致咳嗽时间更长等，因此抗菌药物不能常规使用。
当医师判断急性咳嗽患儿需使用抗菌药物时，可选用口服阿莫西林或阿莫西林-克拉维酸钾，一般服用5~7d。当儿童对青霉素过敏或药物无法获得时，可考虑选用口服第二代头孢菌素或大环内酯类。
宝宝年龄较小，不建议服用药物，但是若是情况严重时，以防病情发展为肺炎，可以适量服用止咳化痰药物或者进行雾化治疗，这样可以快速稀释痰液，促使呼吸道湿润，从而缓解咳嗽有痰的症状。但需要注意的是，止咳化痰药和止咳药概念不同，不可盲目使用止咳药物，不仅会加重病情，更会影响痰液的有效排出，促使痰液滞留气管和肺部，增加肺部感染的可能性。
盐酸溴己新葡萄糖注射液具有多重祛痰机制，祛痰疗效好；具有专利生产工艺，不含乙醇等辅料，不良反应少，应用更安全，广受临床医师认可；本品是应用较为广泛的祛痰药，适用于多种适应症；本品能提高抗生素在肺部的浓度，小剂量大疗效，使用更安全，更适合老幼患者使用。