4.呼吸道病原体核酸检测结果解读及注意事项
4.1 常规核酸检测
常规核酸检测是序列依赖的核酸检测，只能扩增特异性引物所覆盖的核酸序列。随着多重核酸检测方法越来越多的使用，同一份标本中可能会同时检测出多种病原体，提示存在混合感染。临床医师需要结合不同病原体的季节流行特征、生物学特性和致病特点，核酸检测结果提示的病原体相对载量高低，患儿临床特征等进行综合分析，以明确哪一种病原体是主要病原体。
4.1.1 核酸检测阳性
上、下呼吸道标本的病原体核酸阳性结果在病*、细菌、非典型病原体及真菌感染中的诊断价值有差别。若核酸检测阳性结果与临床表现严重不符，要注意是否有引物的特异性差和实验室污染等方面的问题，另外，痰液也有被上呼吸道病原污染的可能，临床医师需及时与实验室方面沟通。
4.1.1.1 病*
急性期上或下呼吸道标本检测阳性，可提供病原学参考。由于部分病*存在较高的无症状感染率，故上呼吸道标本的阳性结果要结合临床综合考虑，下呼吸道标本的病原学诊断价值更大。
4.1.1.2 细菌
下呼吸道标本、血液等无菌体液标本核酸阳性检测结果具有诊断价值；百日咳鲍特菌主要感染鼻咽部，上呼吸道标本检测阳性具有诊断意义。
4.1.1.3 非典型病原体
上、下呼吸道标本核酸检测阳性，多数情况下对肺炎支原体、肺炎衣原体和*团菌等非典型病原体具有诊断价值，但下呼吸道标本结果更具有病原学价值。
4.1.1.4 真菌
下呼吸道标本、无菌体液、器官组织、鼻窦分泌物等标本真菌检测阳性结果，具有诊断价值。
4.1.2 核酸检测阴性
（1）结合患儿临床表现除外某种病原体感染。（2）若临床高度提示某种病原体感染，但核酸检测阴性，要考虑标本是否合格、病原体可能存在变异、试剂的检测阈值和质量以及实验室检测等方面的问题，临床医师要及时与实验室反馈和沟通。
4.2mNGS
mNGS的标准操作、数据分析、结果判读等尚无标准化流程，但随着mNGS技术在临床上的不断推广，国内临床和检验领域发布了一系列专家共识，对mNGS中存在的某些共性问题，尤其是结果报告和解读提出建议。mNGS病原检测结果可向临床提供有效的线索，但存在一定的局限性，建议由具有一定生物信息学知识，并从事临床感染或临床微生物等专业人员，结合患儿临床背景、影像学资料、其他实验室检查结果进行综合判断，避免盲目依据mNGS报告开展治疗，导致抗微生物药物的滥用。
4.2.1 报告内容
（1）报告病原体列表：建议按照细菌、病*、真菌和寄生虫等病原体类型以及临床