标题：Applicationofnextgenerationsequencing-basedrapiddetectionplatformformicrobiologicaldiagnosisanddrugresistancepredictioninacutelowerrespiratoryinfection
作者：LingshanChao1#,JihongLi2#,Ya’nanZhang3,HaoPu3,XixinYan1
杂志：AnnalsofTranslationalMedicine
IF：3.
文献导读急性下呼吸道感染(ALRI)是世界范围内的常见疾病，死亡率很高，尤其是在儿童中，约占儿童死亡人数的30%。目前，关于ALRI的检测和治疗存在两个主要问题。首先，传统的痰培养(SC)诊断在探查许多微生物时敏感性低，其次，合格的痰液来自下呼吸道，经过口腔，口腔内的微生物可能会污染痰液。严重的急性细菌感染是一个巨大且不断增长的医疗保健负担，但传统的培养方法（如SC）表现出低检出率。鉴于传染病病原体鉴定的困难，迫切需要替代诊断方法，这些方法具有快速、简单的批处理功能来检测多种微生物。为了解决ALRI患者的诊断和耐药性预测挑战，我们应用了一个快速检测36种微生物和49种抗生素耐药性标志物的平台。与传统的SC方法相比，我们的研究结果显示出测序方法的显著优势。下一代测序(tNGS)可以最大限度地减少痰液检测中污染的影响。
01研究方法
1、入组实验的例下呼吸道感染的患者中，痰培养阴性，痰培养阳性.（图1）
2、对痰培养阳性的例标本进行tNGS检测，阳性，整体符合率95.62%。（图2）
02研究结果
tNGS对病原体识别是有效的，尤其是对于那些使用传统SC方法难以观察的病原体。
与传统的SC方法相比，测序在病原体检测方面具有更高的灵敏度，具有普遍令人满意的特异性。
参考文献
*1.LingshanChao,XixinYan,etal.AnnTranslMed;8(24):.
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